Краситель, в состав которого входят бромфеноловый синий, ксиленцианол FF (XCFF), рекомендован для анализа образцов ДНК с высоким содержанием ДНК-связанных белков на агарозном геле после рестрикции, лигирования или дефосфорилирования. Присутствие 1% SDS устраняет ДНК-белковые связи и предотвращает появление на геле дополнительных полос при отжиге ДНК-молекул с липкими концами. Высокая концентрация EDTA, 100 mM защищает ДНК от разрушения метал-зависимыми нуклеазами.