Набор для приготовления библиотек для секвенирования определённой (+ или -) цепи мРНК, включающий все необходимые компоненты.
Эти библиотеки предназначены для следующих задач:
построение точного экспрессионного профиля;
секвенирование транскриптома;
выявление и количественная оценка антисмысловых транскриптов и перекрывающихся генов.
Исходным материалом для получения библиотек является суммарная РНК. С помощью набора SENSE можно получать библиотеки для секвенирования на платформе Ion Torrent (аналогичный набор предлагается для платформы Illumina). Предусмотрена возможность мультиплексирования – могут использоваться инлайн-баркоды (Cat. No. 007.08 и 007.24), позволяющие объединять в одну библиотеку до 24 образцов.
В состав набора входят все необходимые компоненты для подготовки библиотеки:
набор реагентов для получения библиотеки;
комплект для обогащения мРНК Poly(A) RNA Selection Kit;
набор буферов и колонок для очистки РНК;
дополнительные реагенты не требуются.
При получении библиотеки с помощью наборов SENSE используется технология замещения цепи stop/ligation. В отличие от технологии переключения цепи в протоколах с фрагментацией, эта технология даёт минимальное количество антисмысловых артефактов, что делает наборы SENSE незаменимыми при цепь-специфичном секвенировании РНК и выявлении антисмысловых транскриптов.
Входящий в набор Poly(A) RNA Selection Kit (его можно также приобрести отдельно) обеспечивает эффективную элиминацию рибосомальной РНК. Доля ридов рРНК составляет не более 0.001%.