Программное обеспечение для морфометрии изображений биологических препаратов – мощный универсальный инструмент, позволяющий напрямую управлять
процессами ввода изображений, сканированием препаратов, а также автоматизировать методики рутинного анализа изображений биологических препаратов и образцов: подсчет
количества, измерения и классификацию клеток, определение ядерно-цитоплазматического отношения, плоидности по Фельгену, вычисление
площади и объемной доли составляющих в биологических тканях и мн. др.
Основные возможности программы:
Основу программы составляют методики – настраиваемые и сохраняемые последовательности операций по обработке изображения, выполняемых в автоматическом режиме.
Программа содержит набор методик, предназначенных решения для наиболее часто встречающихся задач анализа изображений.
При необходимости пользователь может адаптировать любую из методик под свою задачу, изменив настройки работы методики.
- Архивирование
- Расширенный фокус
- Сшивка живого видео
- Улучшение качества
- Ручные измерения
- Распределение по параметру
- Процент количества
- Стереометрия
- Оптическая плотность с указанием фона вручную
- Оптическая плотность с вводом фоновых полей
- Оптическая плотность с вводом эталонов
- Изменение во времени
В комплект поставки могут входить специализированные методики, разработанные для решения специальных задач пользователя. Специализированные методики
могут быть включены в программу на коммерческой основе. Данные методики защищены с помощью электронного ключа, и не могут быть изменены.
На настоящий момент поставляются следующие дополнительные методики:
- Плоидность
- Ядерно-цитоплазматическое отношение
- Ретикулоцитометрия
- Подсчет колоний
- Измерение частоты
- Процент количества жизнеспособных клеток
Методики представляют собой сохраняемые и изменяемые в соответствии с задачей пользователя последовательности обработки изображения. В методику
могут быть включены любые из ключевых и дополнительных функций программы.
Ключевые функции программы:
- Ввод изображений с помощью телевизионных и цифровых камер (в том числе 8, 10, 12, 16 битных), сканера, открытие изображений из файлов, копирование из буфера.
- Выделение области интереса на изображении.
- Преобразование изображений с помощью фильтров (повышение яркости, контраста и визуального качества исходного изображения, морфологические преобразования).
- Выделение объектов и фаз на изображении по яркости и цвету в автоматическом режиме.
- Автоматическое измерение выделенных объектов по параметрам площади, размера, формы, положения, движения, цвета, оптическим и пользовательским параметрам.
- Проведение ручных измерений (линейные, угловые, радиус окружности, подсчет количества объектов и т.д.).
- Автоматическое измерение объектов, нанесенных на изображение вручную.
- Функция калибровки программы для проведения измерений площади и размера объектов в реальных величинах.
- Представление результатов измерений в табличной форме.
- Широкие возможности классификации объектов.
- Детальный статистический анализ полученных данных, в том числе построение гистограмм распределения, графиков зависимости, расчет стереологических параметров.
- Передача изображений и полученных результатов во встроенную базу данных.
- Сохранение изображений и полученных результатов, вывод на печать в виде стандартных отчетов.
Дополнительные функции программы:
- Работа с серией изображений, относящихся к одному эксперименту, образцу или препарату. Получение объединенных данных статистического анализа по результатам обработки изображений нескольких полей зрения.
- Нанесение на изображение графики (текстовых комментариев, стрелок, калибровочных маркеров).
- Сшивка «живых» изображений полей зрения с получением единого панорамного изображения.
- Получение резкого изображения из серии изображений, части которых находятся не в фокусе.
- 3D реконструкция изображения по яркости.
- Анализ яркостных разрезов.
- Экспорт таблицы данных в MS Excel.
Пользовательские установки критериев набора достаточности данных.
Для работы в интерактивном режиме доступна версия программного обеспечения для ручных измерений.
Основные возможности программы:
- ввод изображений с помощью телевизионных и цифровых камер (8, 10, 12, 16 битных), сканера, открытие изображений из файлов, копирование из буфера;
- работа с серией изображений, относящихся к одному эксперименту, образцу или препарату, и результатами их измерений в составе одного документа;
- сохранение серии изображений с результатами измерений в одном документе;
- преобразование изображений с помощью фильтров;
- нанесение на изображение текста, графики, а также фигур и линий для выделения интересующих элементов, возможность обмена графикой между изображениями;
- автоматическая «сшивка» изображений;
- получение резкого изображения из серии изображений, части которых находятся не в фокусе;
- линейные и угловые измерения, подсчет количества объектов;
- автоматические измерения для нанесенных вручную контуров объектов (около 40 параметров);
- статистическая обработка результатов измерений, передача данных в MS Excel;
- возможность создания многостраничных отчетов;
- сохранение изображений и данных, вывод на печать.